Fyrsta þrívíddarlíkanið af erfðamengi einstakra frumna

Vís­inda­mönnum hefur tek­ist í fyrsta sinn í sög­unni að útbúa þrí­vídd­ar­líkan af upp­bygg­ingu erfða­mengis músa í ein­stökum frumum. Með tækn­inni má sjá hvernig litn­ingar raða sér upp í þrí­vídd í kjarna frumunnar og hvernig þeir stilla sér upp til að virkja og óvirkja ákveðnar frumur.

Í rann­sókn­inni, sem birt var í tíma­rit­inu Nature, skoð­uðu vís­inda­menn myndir af erfða­mengi stofn­frumna músa á myndum í afar hárri upp­lausn. Tækni sem nefn­ist Hi-C var síðan notuð til að reikna út upp­bygg­ingu erfða­mengis frumunnar út frá stað­setn­ingu erfða­efn­is­ins (DNA). Vís­inda­menn­irnir gátu síðan raðað saman þrí­víðum lík­önum og sann­reynt hvaða gen voru virk hverju sinni.

Enn sem komið er hefur tæknin ekki verið prófuð á manna­frumum en vonir standa til að með því að þróa tækn­ina frekar verði komið tól sem gæti nýst til að skilja hvernig dýr vaxa og hvernig gallar í virkni frumna leiðir til sjúk­dóma, til dæmis krabba­mein.

[adspot]

Hér að neðan má sjá tvö mynd­bönd sem sýna hvernig þrí­vídd­ar­lík­önin líta út. Í því fyrra má sjá hvar 20 mis­mun­andi litn­ingum hefur verið gef­inn sinn litur og hvernig þeir raða sér upp í frumunni. Seinna mynd­bandið sýnir síðan svæði á litn­ing­unum þar sem gen eru virk í bláum lit og svæði þar sem þau eru minna virk í gulu.